La Mk II era l'unica versione del Lancaster a non essere alimentata da motori Rolls Royce Merlin. Invece, ha usato motori raffreddati ad aria radiali Bristol Hercules. L'obiettivo era quello di fornire una fonte alternativa di Lancaster nel caso in cui la fornitura di motori Merlin fosse fallita. La produzione britannica era vista come vulnerabile ai bombardamenti tedeschi, mentre si temeva che la produzione americana (da Packard) sarebbe stata deviata o interrotta se l'americano fosse entrato in guerra.
I lavori sul prototipo Mk II sono iniziati subito dopo il mk io era completo e il primo prototipo volò il 26 novembre 1941. Il nuovo modello fu prodotto da Armstrong Whitworth, con inizio dei lavori nel marzo 1942. Ironia della sorte, mentre Rolls Royce era immune da gravi attacchi, la stessa fabbrica Armstrong Whitworth fu bombardata nel giugno 1942, ritardando la comparsa della Mk II.
Schema di pittura 1 - Avro Lancaster BII 'Z-Zombie', No.408 (Goose) Squadron, 6 Group, Royal Canadian Air Force, Royal Air Force Linton-On-Ouse, Yorkshire, luglio 1944.
Schema di pittura 2 - Avro Lancaster BII 'Fanny Ferkin II' No.514 Squadron, 3 Gruppo, Royal Air Force, Waterbeach, Cambridgeshire, novembre 1944.
